Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp7Q6A4J8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp7Q6A4J8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp7Q6A4J8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp7Q6A4J8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp7Q6A4J8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp7Q6A4J8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp7Q6A4J8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp7Q6A4J8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp7Q6A4J8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms