Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rftn1Q6A0D4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms