Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnna3Q65CL1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms