Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stx3Q64704 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms