Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2a3Q64518 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms