Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PtprdQ64487 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprdQ64487 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms