Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sf1Q64213 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sf1Q64213 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms