Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ift52Q62559 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ift52Q62559 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ift52Q62559 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ift52Q62559 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ift52Q62559 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ift52Q62559 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ift52Q62559 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ift52Q62559 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ift52Q62559 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ift52Q62559 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ift52Q62559 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift52Q62559 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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