Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms