Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms