Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AtmQ62388 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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AtmQ62388 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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AtmQ62388 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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AtmQ62388 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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AtmQ62388 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtmQ62388 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtmQ62388 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtmQ62388 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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