Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kdm5dQ62240 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5dQ62240 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms