Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms