Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema3bQ62177 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sema3bQ62177 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms