Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbm38Q62176 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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