Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms