Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd53Q61451 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Cd53Q61451 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Cd53Q61451 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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