Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Foxd1Q61345 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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