Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tfap2bQ61313 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms