Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms