Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hif1aQ61221 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms