Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Foxd3Q61060 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Foxd3Q61060 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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