Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms