Protein–RNA interactions for Protein: Q60953

Pml, Protein PML, mousemouse

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmlQ60953 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PmlQ60953 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms