Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ripk1Q60855 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ripk1Q60855 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ripk1Q60855 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ripk1Q60855 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ripk1Q60855 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms