Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcf4Q60722 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms