Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psmb6Q60692 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms