Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1h2Q60644 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nr1h2Q60644 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms