Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpa6Q5U901 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpa6Q5U901 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpa6Q5U901 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpa6Q5U901 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpa6Q5U901 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpa6Q5U901 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpa6Q5U901 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpa6Q5U901 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpa6Q5U901 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpa6Q5U901 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpa6Q5U901 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms