Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rabl6Q5U3K5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms