Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms