Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd40Q5SUE8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms