Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RilpQ5ND29 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RilpQ5ND29 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms