Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm12253Q5NC48 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm12253Q5NC48 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm12253Q5NC48 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm12253Q5NC48 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm12253Q5NC48 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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