Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps41Q5KU39 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms