Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SynaQ5G5D5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms