Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ecm2Q5FW85 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms