Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nlrc3Q5DU56 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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