Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Rtl5Q5DTT4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Rtl5Q5DTT4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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