Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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