Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc27a5Q4LDG0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms