Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arap1Q4LDD4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arap1Q4LDD4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms