Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Afg1lQ3V384 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms