Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc110Q3V125 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms