Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms