Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrrc43Q3V0L5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrrc43Q3V0L5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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