Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms