Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms