Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E330034G19RikQ3UWX6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms