Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pfdn4Q3UWL8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pfdn4Q3UWL8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pfdn4Q3UWL8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pfdn4Q3UWL8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn4Q3UWL8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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